Afin d'éviter de ne pas oublier de sauvegarder les fichiers modifiés dans ckeditor pour le personnaliser, il m'est apparu plus efficace de créer un dossier custom dans lesquels je mets mes fichiers de configuration.
Pour l'exemple je m'appuirai sur le plugin ckeditor pour PluXml.
Comme indiqué précedemment, nous allons dissocier le dossier themes/defaut en deux : defaut et common. Le dossier common comprendra trois sous-dossiers (css, img, js ) dans lesquels nous mettrons les fichiers qui pourront être commun à tous les sous-sites ou sites.
Celle-ci concerne la modification des thèmes, en aprtant sur l'idée qu'il y a une partie commune à tous le site et sous-site ( plugin, reset, etc) et une partie spécific au site. Ces deux parties seront à la racine du site et non pas à l'intérieur du dossier thèmes ( on aurait pu, mais comme il n'y aura qu'un seul thème...)